Chip-seq 是一种研究蛋白质和 DNA 互作的方法，通过染色质免疫共沉淀技术（ Chip ）和高通量测序技术 (NGS) 结合在全基因组范围对 DNA 互作蛋白的结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定。

利用特异性抗体通过免疫沉淀将目的蛋白以及结合的 DNA 捕获，对分离后的 DNA 进行建库测序，比对以及 peak calling 可得到目的蛋白全基因组范围内的结合位点，多样本比较可获得差异 peak 位点，对差异 peak 相关基因进行功能分析。

信息分析内容：

1. 原始数据质控

2. 与参考基因组序列的比对

3. Peak Calling （统计每个样品的 Peak 片段信息）

4. 峰值分布分析

4. Peak 基因注释与富集分析

5. Motif 预测、基因集分析

7. 样品间差异 Peak 分析

8. 差异 Peak 功能分析

标准分析 10 个自然日

样品要求

样品类型： DNA 样品；

总量： ≥ 50 ng ChIPed DNA （人类样本可以低至 5ng ）；

浓度： ≥ 1 ng/ μ L ；

纯度： OD260/280= 1.8 -2.0 ；