甲基化测序分析
全基因组重亚硫酸盐测序(
WGBS)
是一种鉴定
DNA甲基化
水平的方法,利用
重亚硫酸盐处理基因组
DNA
结合高通量测序(
NGS
)可
在全基因组单碱基水平上
衡量
DNA甲基化水平
。
信息分析内容:
1)
质控
2)
与参考基因组比对
3)
全基因组甲基化
位点鉴定
4)
甲基化
基因组分布
5)
转录元件甲基化
水平
6)
甲基化差异
分析
7) 差异甲基化位点功能注释
样品要求
样品类型:
DNA
样品;
总量:
≥
5
μ
g DNA
浓度:
≥
50 ng/
μ
L
;
纯度:
OD260/280= 1.8 -2.0
;