变异检测分析
变异检测:对个体或者群体数据进行与参考基因组比对,检测遗传变异信息:单碱基突变(SNP),插入缺失(InDEL),结构变异(SV)以及拷贝数变异(CNV),并对这些变异进行注释及统计,为后续单个样本的生物学问题挖掘,多样本之间的关联和差异分析奠定分析基础。
分析内容
分析内容 |
分析内容 |
SNP |
检测 , 注释及统计 |
InDEL |
检测 , 注释及统计 |
SV |
检测 , 注释及统计 |
CNV |
检测 , 注释及统计 |
高级分析 |
联合分析 |
样品要求 :
每个样本DNA总量>=1.0ug,OD值260/280为1.8~2.0;
根据研究物种和研究目的推荐测序深度选择15X/30X/50X
项目周期:
标准分析15个自然日