10X免疫组库
T淋巴细胞(T cell)和B淋巴细胞(B cell)主要负责适应性免疫应答,其抗原识别主要依赖于T细胞受体(T cell recptor, TCR)和B细胞受体(B cell recptor, BCR),这两类细胞表面分子的共同特点是其多样性,可以识别多种多样的抗原分子。BCR的轻链和TCRβ链由V、D、J、C四个基因片段组成,BCR的重链和TCRα链由V、J、C三个基因片段组成,这些基因片段在遗传过程中发生重组、重排,组合成不同的形式,保证了受体多样性。
传统免疫组库研究方式局限性较大,10x Genomics新推出的“单细胞免疫谱分析”利用其微流控芯片制备单细胞体系,选择5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行V(D)J富集,实现在单细胞水平,对成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)进行全长测序,为免疫组库全面、系统的研究提供了高效的技术平台,对疾病发生、发展的分子机制研究有重要的意义
分析内容:
标准信息分析 |
1. 测序数据统计与 质控 2. 比对与注释 3. Clonotype分型 4. 特征分析、CDR3特征分析、V/J基因特征分析、V-J paired特征分析 5. 多样本分析:Clonotypes比较、Overlapping Clonotype聚类分析 与 差异分析 |
项目周期:
30个自然日