16s/18s/ITS及宏基因组分析
2018-07-24 10:35:03
微生物的群落多样性分析主要基于
16s/18s/ITS
分析,利用二代测序技术分析环境中物种的种类和结构,揭示各种微生物的相对丰度,进化关系,对于人类健康,食品安全,环境检测与治理等有着重要意义。
16s
测序主要是对原核生物的
16s rDNA
某个高变区进行测序。
18s
是针对真核生物的
18s rDNA
高变区进行测序,而
ITS
测序主要是对环境中的真菌多样性进行分析。
宏基因组分析不需对环境中细菌微生物进行分离培养,而是通过提取环境中整个细菌微生物群落的总
DNA
,利用
Illumina HiSeq
测序仪进行高通量测序,并进行生物信息学分析,来研究细菌微生物与环境、与宿主相互之间的关系,它摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制,相对于
16s/18s/ITS
分析能够更好的挖掘低丰度的微生物群落。
项目周期:
8-10
个自然日